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控制不同形状的遗传因子的分离和组合是互不干扰的,在形成配子时,决定同一性状的成对的遗传因子彼此分离,决定不同性状的遗传因子自由组合。后人把这一遗传规律称之为孟德尔第二定律,也叫自由组合定律。孟德尔遗传定律在杂交水稻的育种中也发挥了作用。水稻是自花授粉作物,那么自然界中应该都是纯种,但中国育种学家袁隆平在试验中发现,把一株自然“纯种”的优良水稻植株的种子播到试验田后,秧苗性状却参差不齐,但数量上却符合孟德尔分离定律。他由此断定:这个特异的稻株应该是天然的杂交稻。从此,中国杂交水稻研究进入一个新纪元。