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1997年，据澳大利亚《时代报》和英国军事期刊《简氏周刊》报道，以色列与美国达成了一项协议，美军可以向以色列提供中子弹，一旦伊拉克向以色列发动生化武器袭击，以色列将使用中子弹进行报复。沙龙在与来访的美国国务卿鲍威尔交谈时向伊拉克发出强硬信息：如果伊拉克再度向以色列挑衅，以色列决不会像海湾战争期间那样默不作声。而且只要伊拉克露出袭击以色列的苗头，以色列就会先发制人，让伊拉克尝尝中子弹的滋味。

在2003年伊拉克战争期间，美国就威胁一旦伊拉克动用生化武器，美国就将使用中子弹和核地雷等小型战术核武器。2007年4月，前伊拉克共和国卫队司令萨拉维在接受卡塔尔半岛电视台采访时，谴责美军在2003年4月9日攻陷巴格达前，在攻占巴格达机场时使用了中子弹和白磷弹。拉维说：“敌人对巴格达机场使用了中子弹和白磷弹，有的尸体被烧得只剩下骨头。”拉维称，美军使用的这些武器消灭了伊拉克士兵，大约有2000名伊拉克共和国卫队的精锐士兵“战斗至死”，但机场的建筑和其他基础设施却奇怪的没有受到损毁。

不过，西方媒体认为拉维是无中生有，给前伊拉克共和国的失败找借口。专门研究美军军事技术的英国专家大卫·甘布林认为，美军在伊战中不太像用了中子弹，更有可能是用了热气压型武器，比如“地狱之火”导弹。

甘布林还透露，2003年3月15日，美军攻占巴格达机场一周之际，时任美国防部长的拉姆斯菲尔德曾称赞美军新式武器在巴格达机场一役中居功至伟。拉氏说：“这种武器能将地上或地下建筑物里的所有敌人都杀死，但不会损毁楼内任何硬件设施。”而热气压型武器就能做到这一点。

巴士拉省的医生阿尔·法洛基曾描述了一辆公共汽车遭袭的惨景：“汽车在行驶途中被美军直升机炸弹击中。有26名乘客死亡，其中有20人或者没了头，或者没了胳膊和腿，但从他们身上没有发现炸弹碎片或子弹头，……美国大兵显然是在拿这里（伊拉克）当新式武器的试验场。”

萨达姆国际机场的争夺战揭开了美英联军围攻巴格达的序幕

在阿富汗的反恐行动中，塔利班恐怖分子给驻阿富汗的美军和英军造成了很大伤亡。奥巴马政府在决定逐批撤出驻军时，也希望保留几个常驻基地。为了确保余下驻军基地的安全，防止恐怖分子的袭击，2012年，约翰•吉尔伯特（John Gilbert）在英国上议院中提议，在巴基斯坦和阿富汗边界上投下一枚中子弹，以便为恐怖分子设置一道“屏障”。吉尔伯特说，没有人住在那里，除了“几只山羊和一小撮牧羊人”，只要通知他们要发动打击，他们也不会往那里去，对恐怖分子使用中子弹并不会存在很大的使用障碍。

2015年，由沙特领导的阿拉伯联军发动了对也门胡塞武装的打击。5月20日，一架来自以色列的类似F-16的单引擎喷气式飞机，向也门首都萨那周围投放了炸弹，希拉里的邮件门中证实，这是一枚中子弹，由美国提供给以色列。爆炸过程伴随强烈的闪光，蘑菇云持续了很长一段时间。