某种氨基酸的亲水指数(hydropathy index)是一个描述其支链的亲水性或疏水性程度大小的值。“亲水指数”于1982年被Jack Kyte与Russell Doolittle提出。亲水指数越大,这种氨基酸的疏水性就越强。
简介某种氨基酸的亲水指数(hydropathy index)是一个描述其支链的亲水性或疏水性程度大小的值。“亲水指数”于1982年被Jack Kyte与Russell Doolittle提出。亲水指数越大,这种氨基酸的疏水性就越强。
亲水指数是根据蒸汽至水相转移的ΔtrGm以及在形成蛋白质时氨基酸在表面和内部的分布测算的。疏水性最强的两种氨基酸分别是异亮氨酸(亲水指数为4.5)与缬氨酸(亲水指数为4.2);亲水性最强的两种氨基酸分别是精氨酸(亲水指数为-4.5)和赖氨酸(亲水指数为-3.9)。
| -4.5 | -3.9 | -3.5 | -3.5 | -3.5 | -3.5 | -3.2 | -1.6 | -1.3 | -0.9 | -0.8 | -0.7 | -0.4 | 1.8 | 1.9 | 2.5 | 2.8 | 3.8 | 4.2 | 4.5 |
| -2.5 | -1.5 | -0.90 | -0.85 | -0.78 | -0.74 | -0.40 | -0.18 | -0.05 | 0.12 | 0.26 | 0.29 | 0.48 | 0.62 | 0.64 | 0.81 | 1.1 | 1.1 | 1.2 | 1.4 |
亲水指数在蛋白质结构的研究中十分重要。具有疏水性的氨基酸在蛋白质的三维结构中更常见于蛋白质的内部,而具有亲水性的氨基酸更常出现在蛋白质的表面。
另一个重要用途是预测膜蛋白在细胞膜中的分布。如果发现膜蛋白有连续二十个左右的氨基酸都具有较强的疏水性,那么很有可能这一段氨基酸是膜蛋白横跨细胞膜的部分。1
本词条内容贡献者为:
段春伟 - 教授级高工 - 中国新兴建设开发总公司亲水指数
图文简介
某种氨基酸的亲水指数(hydropathy index)是一个描述其支链的亲水性或疏水性程度大小的值。“亲水指数”于1982年被Jack Kyte与Russell Doolittle提出。亲水指数越大,这种氨基酸的疏水性就越强。
- 来源: 科普中国科学百科
- 上传时间:2018-11-15
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