尽管参与水资源方面的研究也有三四十年了，但并不很深入，因此，这里的所谓短板仅是个人感受而已，不是科学结论，更不是权威观点。

短板一：工程

每一滴水的开发，都需要工程，因此，研究水资源及其配置和利用，都不能少了工程这个基础，包括工程力学、工程施工、工程经济学等。目前，很多水资源研究就水论水，全是水资源量数据，加N个箭头。从水量上可以调配的，从工程学上就未必可行。一个水量需求可以通过几类工程措施实现，都要相互仔细比选，包括水资源条件的比较和工程条件的比较，尤其是经济比较，不存在“不惜代价”的开发方案。

短板二：水质

水资源本身包括数量和质量两个特征属性，都对水资源开发利用产生重要的影响。目前的大多数水资源研究均集中在水量方面，水资源形成及利用过程中水质的演变也有研究，但都背对背，相互没有耦合分析和方案选择。有的地方水量丰富，但水质不好。不同的用户和不同的水质之间要合理调配，不能见超采区就替换地表水。有的地表水水质不好，影响健康，例如藻毒素就致癌。

短板三：抗旱

枯水年的抗旱算水资源问题还是减灾防灾问题？很多水资源研究都聚焦在常态水平的保证率上，如果这样，水资源研究慢慢也就没什么好干的了，因为随着工程能力的提升，平水及偏枯年供水都不会有问题。个人感觉，抗旱是水资源问题，因为不是突发的灾害，而是灰犀牛，需要平时就做好水资源基础调查、战略储备及预案、应急供水水价机制及政策等工作，临时抱佛脚不行。防洪在倾向应对超标准洪水，水资源也要倾向于极端旱情的应对。

短板四：水能

传统意义的水资源是指水量（水质作为限制条件），其实，水能也是水资源的重要组成部分，包括地表水的水能开发和地热资源的开发。为什么水能要和水量统筹起来研究和管理呢？因为二者有竞争性，需要放在一起，而不能各说各话。

水资源研究还有很多其他的薄弱环节，例如，水资源开发利用与管理中的社会学和经济学问题等。据说，很多地方的阶梯水价根本没有起到阶梯的作用，就是因为社会经济学机制没搞清楚，哪些用水是刚性的社会需求，哪些是福利性的经济需求。